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STR檢測服務來分析分析STR的原理

  • 發布日期:2017-11-20      瀏覽次數:4299
    •    STR檢測服務來分析分析STR的原理
        短串聯重復序列(short tandem repeat, STR),也稱微衛星 DNA(microsalite DNA) ,是由2 - 6個堿基對作為核心單位,串聯重復形成的一類DNA序列,由于核心單位重復數目在個體間呈高度變異性并且數量豐富,構成了STR基因座的遺傳多態性。它分布于人類整個基因組,平均每15 kb就存在一個STR基因座。人類基因組內已發現了七千個以上的STR位點。它具有分布廣泛,易于檢測,信息量大,有高度多態性并遵循孟德爾共顯性遺傳等優點。是繼限制性片段長度多態性 (RFLP) 之后的第二代遺傳記,目前STR分析已廣泛應用于遺傳制圖、連鎖性分析、法醫學鑒定、疾病基因定位、物種多態性和遺傳病的診斷等諸多領域。
        微衛星(STR)檢測服務流程
        1. 客戶提供
        A.如果提供基因組DNA:至少提供100 ng DNA樣品(針對每個多態性位點,需樣品3-5 ul,濃度為30 - 50 ng/ul)
        B.如果提供PCR產物:產物要通過預實驗的電泳檢測,特異性要好
        C.如果需要設計引物,請提供目的片段序列或者微衛星檢測位點,引物設計好后需要客戶確認。
        D.除提供樣品類型,DNA濃度和純度值外,還需要注明可能殘留的抑制劑成分。樣品溶解在ddH2O中,如果不是,請注明溶解液成分。
        2. 確定STR位點,設計實驗方案,包括熒光標記的選擇,引物的設計、合成和標記,熒光分子量內標的選用等。
        3. 按照所設計的實驗方案完成熒光PCR,利用瓊脂糖電泳檢測結果;若PCR產物特異性不夠,將進行優化。
        4. PCR產物通過ABI 3730XL 測序儀器進行毛細管電泳檢測,獲得擴增片段大小的數據
        5. 用GeneScan 3.0/GenoTyper 2.0或GeneMapper 3.2等軟件對收集到的數據進行處理分析,將產物片段大小、數量多少的信息轉化成直觀準確的波形圖譜,為下一步進行關聯分析或連鎖分析等遺傳分析提供可靠的數據。
        6.發送準確的微衛星(STR)分型結果報告及PCR產物。
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